UKS

Ruang UKS SMAN 3 Yogyakarta selain sebagai tempat istirahat bagi warga sekolah yang sedang sakit, juga melayani konsultasi serta pemeriksaan oleh dokter jaga yang datang seminggu sekali. Dokter jaga yang bertugas di UKS merupakan alumni SMAN 3 Yogyakarta.