Pencak Silat (Perisai Diri)

Perisai Diri merupakan ekstrakulikuler beladiri di SMAN 3 Yogyakarta. Dalam perisai diri akan diajarkan teknik-teknik pertahanan diri yang dapat diterapkan dalam kehidupan sehari-hari. Perisai diri di SMAN 3 Yogyakarta berbeda dengan perisai diri di sekolah atau komunitas lain. Prinsip yang diterapkan Asah, Asih, Asuh. Oleh karena itu, perisai diri SMA N 3 Yogyakarta berhasil menorehkan banyak sekali prestasi pada event-event besar, seperti O2SN dan POPDA.